ईशान खट्टर का जन्म साल 1995 में अभिनेत्री नीलिमा अजीम और अभिनेता राजेश खट्टर के घर में हुआ था। राजेश खट्टर ने नीलिमा अजीम से साल 1990 में शादी की थी, लेकिन इन दोनों की शादी 11 साल ही चल सकी। इसके बाद दोनों का तलाक हो गया था। ईशान खट्टर अभिनेता शाहिद कपूर के छोटे भाई हैं। ईशान खट्टर ने अपनी पूरी पढ़ाई मुंबई से ही की है।